磁悬浮鼓风机需要对磁悬浮轴承供电来提供磁力，功耗较空浮大，并且需要一套备用电源及备用轴承，来避免突然断电对风机造成损坏，一般来说备用轴承都有使用次数的限制。

    磁悬浮轴承及控制器相对空悬轴承来说，结构复杂，故障率高

    空气悬浮风机由于使用外部动压空气，在转速较低的情况下，主轴存在干摩擦情况，不过这种摩擦对主轴产生的磨损微乎其微。

    冷却系统采用风冷和水冷结合的方式，能够有效保护电机，可实现风机的随时启停。

    鼓风机电机与叶轮直联，无齿轮增速装置，无任何机械接触，无需润滑油系统，没有磨损及能量损耗，维护费用低，动力传递效率达到95%以上。叶轮选用高强度航空铝材、Ti材质，具有优秀的耐磨、抗变形能力，使用寿命达30年以上。采用变频器调速调节风量，比节流阀节能，且风量调节范围广泛，一般为50%～100%。